More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1842 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  98.91 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  98.91 
 
 		 276 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  97.46 
 
 		 276 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  70.25 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  67.74 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  67.74 
 
 		 264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  60 
 
 		 269 aa  252  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  58.45 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  52.29 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  48.33 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  52.56 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  51.61 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  46.3 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  34.6 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  48.25 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  34.74 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  34.62 
 
 		 670 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30.37 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  31.05 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  30.21 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 1026 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.14 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  31.3 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.33 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  33.09 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  33.04 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  33.33 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  33.33 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  27.64 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 623 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 537 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  27.61 
 
 		 637 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  32.69 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  32.43 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  33.33 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  33.6 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.29 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  35 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  31.53 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  34.62 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 704 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 673 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  39.62 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.58 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.25 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  31 
 
 		 1313 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  31.91 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  26.8 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.43 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.81 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.25 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  26.87 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  33.98 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  33.01 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  30.47 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.85 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  25.69 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  31.25 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.91 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  24.75 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  34.91 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>