More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2123 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  67.21 
 
 		 245 aa  347  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  62.45 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  56.57 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  50.98 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  53.67 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  44.4 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  50.68 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  51.14 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  51.14 
 
 		 276 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  48.19 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  34.76 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  38.89 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  32.89 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  44.83 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30 
 
 		 670 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35 
 
 		 1313 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  27.68 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  30.56 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 1026 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  26.52 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  34.29 
 
 		 380 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  36.97 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  31.75 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  34.86 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  24.47 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  34.86 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.35 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  26.45 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  29.61 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  25.13 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 729 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.37 
 
 		 673 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  33.82 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  37.63 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.01 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  33.61 
 
 		 903 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.98 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  28.08 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  28.33 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  27.08 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  34.55 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  32.73 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  32.73 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  25.71 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  28.33 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  32.04 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  34.48 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  32.74 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.1 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 543 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 		 658 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  27.59 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  33.03 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  26.34 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>