More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3825 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
729 aa  1417    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.28 
 
 
707 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.32 
 
 
464 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  40.05 
 
 
464 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  40.9 
 
 
464 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  41.55 
 
 
463 aa  240  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  41.94 
 
 
464 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  38.98 
 
 
464 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.39 
 
 
459 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.97 
 
 
463 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 
612 aa  157  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  30.95 
 
 
630 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 
652 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  30.65 
 
 
669 aa  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  28.21 
 
 
652 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  30.65 
 
 
668 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  30.34 
 
 
684 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  28.29 
 
 
658 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 
642 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  30.45 
 
 
670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 
316 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  27.24 
 
 
617 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.51 
 
 
320 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 
316 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 
316 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 
316 aa  111  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.03 
 
 
311 aa  111  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.91 
 
 
247 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  30.6 
 
 
310 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  30.6 
 
 
310 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  30.6 
 
 
310 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  30.6 
 
 
310 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  30.6 
 
 
310 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  30.6 
 
 
310 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  30.6 
 
 
310 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 
316 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.47 
 
 
320 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  25.19 
 
 
653 aa  108  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  28.63 
 
 
261 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.22 
 
 
441 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.16 
 
 
434 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  27.08 
 
 
768 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  29 
 
 
277 aa  98.2  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  43.59 
 
 
451 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.31 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 
537 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 
374 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  51.92 
 
 
458 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
525 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.23 
 
 
620 aa  94  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 
658 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.63 
 
 
656 aa  93.6  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 
193 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  38.94 
 
 
517 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.65 
 
 
510 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 
218 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
498 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.41 
 
 
510 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  31.05 
 
 
352 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.05 
 
 
694 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  45.53 
 
 
367 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
227 aa  89  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 
487 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  30.85 
 
 
211 aa  88.2  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
209 aa  88.2  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.61 
 
 
424 aa  88.2  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 
388 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
1026 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 
454 aa  87.8  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.65 
 
 
641 aa  87.8  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.95 
 
 
1987 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  42.2 
 
 
286 aa  87.4  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
209 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
420 aa  87.4  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  49 
 
 
229 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.96 
 
 
319 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.19 
 
 
230 aa  87  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  43.52 
 
 
214 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.46 
 
 
533 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
543 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 
218 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
169 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 
241 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  38.68 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
216 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.21 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  42.2 
 
 
185 aa  85.5  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 
216 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.05 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  26.92 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  40.57 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  38.05 
 
 
1313 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.8 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.61 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.2 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>