More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0763 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  45.38 
 
 
263 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  45.38 
 
 
263 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
205 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.5 
 
 
407 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 
263 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  42.98 
 
 
224 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.94 
 
 
350 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.94 
 
 
350 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  47.32 
 
 
260 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  51.38 
 
 
445 aa  98.6  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  50 
 
 
327 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 
261 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  40.83 
 
 
243 aa  98.2  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 
262 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  40.83 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  47.32 
 
 
498 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  44.66 
 
 
631 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  46.43 
 
 
351 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45.87 
 
 
218 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 
388 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  46.43 
 
 
260 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  43.08 
 
 
175 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  42.31 
 
 
398 aa  95.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
623 aa  94.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  46.36 
 
 
320 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.34 
 
 
890 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 
175 aa  92  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 
374 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.02 
 
 
264 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  41.51 
 
 
1313 aa  91.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.69 
 
 
630 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
221 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.47 
 
 
294 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 
215 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 
296 aa  91.3  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
416 aa  90.9  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.83 
 
 
261 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  41.18 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  41.03 
 
 
669 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.83 
 
 
261 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.13 
 
 
637 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.35 
 
 
466 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  44.23 
 
 
1987 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  47.06 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
333 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 
459 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  45.63 
 
 
320 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
220 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
333 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
220 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.85 
 
 
261 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
220 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
220 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.17 
 
 
220 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.15 
 
 
344 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.15 
 
 
344 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
417 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.15 
 
 
344 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
288 aa  88.6  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.15 
 
 
344 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  46.22 
 
 
228 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  38.84 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.9 
 
 
478 aa  88.6  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.71 
 
 
919 aa  88.6  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.57 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.91 
 
 
427 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.27 
 
 
214 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.82 
 
 
248 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  38.83 
 
 
517 aa  88.2  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.54 
 
 
402 aa  87.8  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
217 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.71 
 
 
230 aa  87.8  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  41.51 
 
 
510 aa  87.8  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.39 
 
 
344 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
1755 aa  87.8  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  36.88 
 
 
233 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>