More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2385 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 416 aa  826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  66.19 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  48.21 
 
 		 398 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  63.64 
 
 		 890 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.44 
 
 		 919 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.31 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.06 
 
 		 694 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0499  hypothetical protein  22.67 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 270 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.54 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 169 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  46 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  41.74 
 
 		 271 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40.19 
 
 		 457 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 270 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.87 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  41.48 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 189 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 537 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 449 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 270 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 270 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  40 
 
 		 271 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  37.93 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.78 
 
 		 620 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 658 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 231 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 587 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.96 
 
 		 239 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.46 
 
 		 260 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 270 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 294 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 364 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 270 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.25 
 
 		 631 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  42.57 
 
 		 269 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.58 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.57 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.05 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  39 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  30.08 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.88 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  43 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.31 
 
 		 707 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  38.32 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 658 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.03 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  38.53 
 
 		 669 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.16 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.16 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.08 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.16 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.62 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  31.79 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  29.65 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.14 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.18 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>