35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0499 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  900    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  25.15 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  26.62 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0303  hypothetical protein  22.68 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  26.12 
 
 		 890 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  29.36 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  28.35 
 
 		 1313 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2471  hypothetical protein  28.7 
 
 		 195 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  28.85 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  23.3 
 
 		 570 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.52 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  24.07 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  36.36 
 
 		 204 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 286 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 729 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  24.42 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  29.81 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  30.19 
 
 		 919 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  25.69 
 
 		 670 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  32.18 
 
 		 208 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  24.53 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  28.85 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.16 
 
 		 320 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  29.52 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  25.23 
 
 		 231 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  24.75 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  25.93 
 
 		 658 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  29.13 
 
 		 229 aa  43.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 487 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 		 241 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>