More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0644 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  47.76 
 
 		 670 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  48.74 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.13 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 		 704 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  47.2 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.5 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 673 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  46.21 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  39.17 
 
 		 510 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  48.7 
 
 		 1313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  48.21 
 
 		 505 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.7 
 
 		 517 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 432 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 1026 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  37.9 
 
 		 694 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.11 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 464 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 525 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 490 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 464 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.09 
 
 		 631 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.75 
 
 		 707 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 658 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  37.32 
 
 		 586 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 623 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.81 
 
 		 640 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 537 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.54 
 
 		 266 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 584 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.46 
 
 		 466 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 464 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 463 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 449 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.77 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.57 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 451 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 631 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 679 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.32 
 
 		 620 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.7 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 630 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 445 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38.61 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 584 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 459 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 468 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 		 459 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 638 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.1 
 
 		 402 aa  85.9  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  31.61 
 
 		 734 aa  85.9  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.78 
 
 		 641 aa  85.5  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  37.93 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.07 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  39.62 
 
 		 890 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  37.5 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.5 
 
 		 478 aa  82.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 417 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1687  OmpA/MotB domain protein  42 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  41.25 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.96 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.19 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  36.94 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.47 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 590 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  52.17 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.61 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  36.63 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.57 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>