More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5226 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  52 
 
 
637 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  54.39 
 
 
374 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  49.17 
 
 
543 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.17 
 
 
542 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 
544 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  49.62 
 
 
440 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  50.85 
 
 
498 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  47.5 
 
 
1987 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
388 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 
623 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 
510 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  46.36 
 
 
510 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 
671 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.22 
 
 
320 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 
525 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 
445 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.34 
 
 
294 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.94 
 
 
240 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 
440 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  42.31 
 
 
424 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 
1755 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.87 
 
 
478 aa  99.4  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  45.71 
 
 
533 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
506 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.97 
 
 
517 aa  98.6  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 
679 aa  98.2  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 
445 aa  96.3  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
412 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  43.81 
 
 
533 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.44 
 
 
890 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  40.91 
 
 
1313 aa  94.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
360 aa  94.4  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
459 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
537 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  40.74 
 
 
670 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 
729 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.48 
 
 
407 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.95 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 
638 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 
507 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  44.25 
 
 
640 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.53 
 
 
620 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  41.18 
 
 
311 aa  91.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
209 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  46.22 
 
 
288 aa  91.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
369 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
594 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  44.04 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 
361 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.52 
 
 
319 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.2 
 
 
420 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
458 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
490 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.45 
 
 
463 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.68 
 
 
641 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  45.63 
 
 
277 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 
441 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 
263 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 
468 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  38.52 
 
 
328 aa  89.4  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
432 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
175 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 
231 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 
320 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 
466 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 
540 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  44.95 
 
 
1793 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
386 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
420 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.02 
 
 
412 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.9 
 
 
226 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
456 aa  88.2  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
613 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
386 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  42.45 
 
 
463 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
537 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  40.95 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
306 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 
586 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.22 
 
 
310 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 
310 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.62 
 
 
266 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.22 
 
 
310 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.22 
 
 
310 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
375 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.22 
 
 
310 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.8 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.97 
 
 
352 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.22 
 
 
310 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
316 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.22 
 
 
310 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.95 
 
 
707 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
449 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>