More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3134 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  100 
 
 
357 aa  722    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  63.81 
 
 
373 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  53.74 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  51.21 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  32.16 
 
 
340 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  33.16 
 
 
401 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  28.29 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  40.87 
 
 
273 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  28.87 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 
409 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.76 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  25.78 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
207 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.54 
 
 
170 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.6 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.13 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  26.36 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  26.56 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  26.56 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  26.56 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  26.5 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  26.29 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  45.63 
 
 
669 aa  72.8  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  26.22 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.64 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  26.68 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.65 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  28.68 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.45 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  37.5 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  37.5 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  37.5 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  37.5 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  37.5 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  37.5 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  37.5 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.52 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.19 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.61 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.67 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  32.65 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  26.34 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  25.71 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.19 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 
177 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.58 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.56 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.49 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  25.81 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  31.25 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  37.5 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  34.62 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  35.92 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  35.48 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  33.61 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.19 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  33.94 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 
204 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  39.6 
 
 
166 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  34.23 
 
 
212 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36 
 
 
214 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  26.05 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  38.64 
 
 
672 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.56 
 
 
188 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.66 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  32.56 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  32.38 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.54 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  32.71 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  25.69 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.54 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  25.69 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  25.69 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.69 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  28.98 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
264 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.67 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
218 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.54 
 
 
171 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>