More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3027 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
196 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  74.49 
 
 
196 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  75.26 
 
 
191 aa  294  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  75.63 
 
 
196 aa  292  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  74.74 
 
 
191 aa  291  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  74.74 
 
 
191 aa  291  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  46.7 
 
 
189 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  44.38 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.9 
 
 
234 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  37.07 
 
 
209 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  36.02 
 
 
215 aa  121  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  39.34 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 
449 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.35 
 
 
350 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.35 
 
 
350 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 
445 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.88 
 
 
294 aa  91.3  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.4 
 
 
447 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.35 
 
 
351 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 
440 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.06 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  34.91 
 
 
344 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.91 
 
 
344 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.91 
 
 
344 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.91 
 
 
344 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  29.55 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.79 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.54 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.54 
 
 
429 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.1 
 
 
420 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.94 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.73 
 
 
345 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 
417 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 
367 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  31.93 
 
 
368 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.74 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.13 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  33.33 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  26.98 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.91 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.65 
 
 
427 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.5 
 
 
542 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 
623 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.5 
 
 
543 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  29.07 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.3 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.07 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.92 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
498 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.07 
 
 
401 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  31.18 
 
 
402 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 
369 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 
366 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 
388 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 
428 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.1 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.11 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  53.62 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30.06 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  37.6 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.55 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.55 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.91 
 
 
466 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.79 
 
 
381 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  49.28 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.55 
 
 
345 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.79 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  50.72 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  49.28 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  32.72 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.79 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  28.49 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  37.25 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.54 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>