More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3360 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 484 aa  994    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  28.17 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  29.26 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.24 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.29 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.64 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  25.85 
 
 		 445 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.41 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.35 
 
 		 376 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 335 aa  87.8  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.65 
 
 		 344 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 375 aa  87  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  34.78 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.05 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.04 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.4 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.4 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.84 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.17 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.31 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.31 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.31 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  34.78 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  30.48 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.02 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.15 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.69 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.42 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  37.12 
 
 		 640 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.13 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  37.74 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.76 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  34.57 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.92 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.86 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  41.51 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.61 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.12 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.14 
 
 		 212 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 221 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.95 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.53 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.19 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.7 
 
 		 224 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 231 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 219 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.53 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  38.24 
 
 		 1984 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  34.19 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.76 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  38.24 
 
 		 2000 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40.19 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1987 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  34.75 
 
 		 903 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.23 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  35.78 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  33.54 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  33.73 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.19 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  30.82 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  30.52 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.86 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  28.66 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 221 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>