More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1522 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1984 aa  3975    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  94.99 
 
 		 2000 aa  2616    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  28.52 
 
 		 2118 aa  306  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.43 
 
 		 2434 aa  276  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2418 aa  267  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1757 aa  238  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1278 aa  223  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1702 aa  212  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1580 aa  166  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1260 aa  161  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1260 aa  161  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  24.66 
 
 		 1709 aa  155  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  30.46 
 
 		 898 aa  143  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 		 1700 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  29.67 
 
 		 1402 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  29 
 
 		 924 aa  116  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1222 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1175 aa  106  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1175 aa  104  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  29.78 
 
 		 909 aa  102  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1140 aa  101  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  29.45 
 
 		 2886 aa  99.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 468 aa  94.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 454 aa  94.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 459 aa  93.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1171 aa  92.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  45.45 
 
 		 351 aa  92.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 466 aa  92.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 459 aa  91.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 210 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2853 aa  90.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 296 aa  90.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1898 aa  89.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1441 aa  89.4  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.42 
 
 		 466 aa  89  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.2 
 
 		 447 aa  89  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.44 
 
 		 350 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 225 aa  88.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.44 
 
 		 350 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  36.36 
 
 		 689 aa  88.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 		 443 aa  87  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  27.6 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  44.12 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.28 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.2 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 239 aa  85.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 		 218 aa  84.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.42 
 
 		 327 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 263 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 263 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  52.08 
 
 		 498 aa  84.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 244 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.44 
 
 		 226 aa  84.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.59 
 
 		 344 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.6 
 
 		 345 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.39 
 
 		 457 aa  84  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.59 
 
 		 344 aa  84  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.59 
 
 		 344 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 520 aa  83.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.98 
 
 		 261 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.98 
 
 		 261 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.42 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 262 aa  83.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1809 aa  82.4  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.41 
 
 		 344 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 230 aa  81.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  45.37 
 
 		 286 aa  81.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 623 aa  81.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.58 
 
 		 344 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 294 aa  82  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 239 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.54 
 
 		 345 aa  80.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 264 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 344 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.79 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.55 
 
 		 266 aa  80.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 376 aa  80.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 263 aa  80.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  40.19 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  46.74 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 213 aa  79.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.04 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.63 
 
 		 223 aa  78.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  44.64 
 
 		 240 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  33.54 
 
 		 261 aa  78.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.24 
 
 		 375 aa  78.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 417 aa  78.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 375 aa  78.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2490 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  27.7 
 
 		 2358 aa  78.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  34.44 
 
 		 481 aa  77.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.7 
 
 		 669 aa  77.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>