More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2466 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  38.71 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 440 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.8 
 
 		 447 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 244 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.88 
 
 		 420 aa  98.6  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 449 aa  97.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.65 
 
 		 345 aa  97.1  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  33.82 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 445 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 335 aa  95.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.09 
 
 		 429 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.88 
 
 		 294 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  35.22 
 
 		 381 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 428 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.65 
 
 		 351 aa  92  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.93 
 
 		 350 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.93 
 
 		 350 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 215 aa  91.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.81 
 
 		 240 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.76 
 
 		 445 aa  91.3  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  34.15 
 
 		 392 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.88 
 
 		 337 aa  89.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.7 
 
 		 320 aa  88.6  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  37.27 
 
 		 333 aa  88.2  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.12 
 
 		 417 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.15 
 
 		 394 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.91 
 
 		 427 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.93 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.91 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.41 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.54 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.93 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.93 
 
 		 344 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.93 
 
 		 345 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.67 
 
 		 620 aa  85.9  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.58 
 
 		 478 aa  85.9  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.19 
 
 		 337 aa  85.1  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.92 
 
 		 380 aa  84.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 239 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.32 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.52 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.28 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  32.92 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.31 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  35.04 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 388 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 481 aa  77.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.9 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.46 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.26 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 401 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.85 
 
 		 466 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  28.83 
 
 		 370 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 372 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.96 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 373 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.74 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  36.69 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.05 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.88 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.95 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  37.04 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>