More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1848 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.51 
 
 		 294 aa  95.5  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  39.26 
 
 		 352 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  35.29 
 
 		 233 aa  87.8  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.66 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  41.75 
 
 		 334 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40 
 
 		 330 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 239 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.54 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.37 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.31 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  45.45 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  31.38 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  40 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  35.96 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  30.48 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  35.96 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.62 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  35.23 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.2 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.05 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.56 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.22 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.33 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.84 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.34 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.59 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  40.17 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  40.17 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.43 
 
 		 607 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.69 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  36.45 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.57 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  34.59 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  28.72 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.54 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.02 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  38.74 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.27 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  42 
 
 		 328 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  33.82 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.06 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  35.51 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>