More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0386 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  100 
 
 		 328 aa  676    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  57.45 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  56.84 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  56.53 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  41.74 
 
 		 345 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  42.54 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.83 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.65 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.71 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  33.8 
 
 		 466 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.18 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.97 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.97 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.97 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.46 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.77 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.17 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.03 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  27.57 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.17 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.33 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  27.68 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.33 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  32.31 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  26.78 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  25.07 
 
 		 466 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.67 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  47.96 
 
 		 166 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.62 
 
 		 420 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  45.92 
 
 		 217 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.46 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 		 510 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.08 
 
 		 422 aa  96.3  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  28.13 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.79 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 215 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.76 
 
 		 457 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  44.9 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  44.9 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.46 
 
 		 890 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.17 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.96 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  30.04 
 
 		 392 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.08 
 
 		 230 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 223 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  29.45 
 
 		 362 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  46 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  38.17 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.4 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 216 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  36.24 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  29.46 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.57 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.8 
 
 		 478 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  29.1 
 
 		 363 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.92 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.7 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.82 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  29.03 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  29.77 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.45 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  29.83 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.9 
 
 		 226 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.23 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  43.88 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.23 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.84 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 221 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  37.88 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>