More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06186 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  38.74 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  37.36 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.24 
 
 		 328 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.34 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.12 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.95 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.17 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  38.21 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  38.21 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  39.6 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.95 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  46.74 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  43.16 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.58 
 
 		 607 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.59 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 375 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.18 
 
 		 331 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  40.54 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  37.61 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  37.61 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  40.54 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.61 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  42.31 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.5 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.11 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.72 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.51 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.51 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.75 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.68 
 
 		 447 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>