More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0615 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  36.36 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  37.57 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.98 
 
 		 311 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.54 
 
 		 319 aa  92.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  39.68 
 
 		 320 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.51 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.78 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  45.05 
 
 		 481 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.63 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  34.76 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  34.76 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.58 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 420 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.9 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  39.47 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.54 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.84 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.62 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.3 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  43.93 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.93 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 671 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 		 316 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.4 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.45 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.45 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  44.9 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  39.6 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 637 aa  79  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 537 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  35.94 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.82 
 
 		 607 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.06 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.35 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.4 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  38.35 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.14 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 1755 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.4 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  36.79 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.4 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  45.45 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.14 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.45 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.45 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.38 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.45 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>