More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3645 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 
412 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  95.34 
 
 
386 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  95.6 
 
 
386 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  48.5 
 
 
440 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  44.19 
 
 
478 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  45.96 
 
 
487 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 
727 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 
374 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  47.16 
 
 
1987 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.52 
 
 
320 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.51 
 
 
1755 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.91 
 
 
543 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
544 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.32 
 
 
319 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.98 
 
 
542 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  50.54 
 
 
510 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
637 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.65 
 
 
623 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 
490 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.3 
 
 
427 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
1264 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.84 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.86 
 
 
420 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40 
 
 
402 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.11 
 
 
506 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.62 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  39.63 
 
 
570 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
498 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.11 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  39.38 
 
 
540 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
401 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
428 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  45.03 
 
 
259 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 
440 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.29 
 
 
375 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  40.96 
 
 
792 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.18 
 
 
314 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  48.45 
 
 
261 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  48.45 
 
 
261 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.26 
 
 
345 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 
193 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36 
 
 
510 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.09 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  38.38 
 
 
722 aa  87.4  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.75 
 
 
350 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.75 
 
 
350 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.25 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.42 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  50.53 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  30.99 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  39.82 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.67 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.42 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 
445 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  38.94 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  39.82 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 
445 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.45 
 
 
670 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  39.82 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.44 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  49.5 
 
 
671 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.42 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  35.5 
 
 
342 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 
221 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.39 
 
 
890 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.84 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.76 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  35.16 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.62 
 
 
620 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  37.07 
 
 
722 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  38.84 
 
 
318 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.76 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
630 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  43.18 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.74 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.86 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  41.46 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>