More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0087 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 638 aa  1330    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  44.57 
 
 		 658 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.72 
 
 		 631 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.67 
 
 		 656 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  37.54 
 
 		 631 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.24 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.37 
 
 		 641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.29 
 
 		 640 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  31.4 
 
 		 620 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.09 
 
 		 673 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.83 
 
 		 670 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  30.68 
 
 		 704 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.95 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  32.94 
 
 		 712 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  30.18 
 
 		 694 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 671 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.41 
 
 		 669 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 		 668 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.31 
 
 		 648 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 525 aa  207  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.34 
 
 		 648 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.04 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  26.71 
 
 		 679 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.31 
 
 		 903 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.96 
 
 		 672 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.9 
 
 		 626 aa  190  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 		 673 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  30 
 
 		 710 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  31.42 
 
 		 666 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  31.64 
 
 		 653 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.51 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.02 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 643 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.11 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  30.11 
 
 		 656 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 		 586 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  32.64 
 
 		 677 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.09 
 
 		 665 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 660 aa  151  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 		 642 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  26.36 
 
 		 798 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.88 
 
 		 645 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  23.79 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 778 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.27 
 
 		 630 aa  114  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 		 813 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  25.76 
 
 		 712 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  25.53 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.08 
 
 		 412 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  29.02 
 
 		 293 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.13 
 
 		 1313 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 364 aa  97.8  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 		 432 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 241 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 296 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.54 
 
 		 239 aa  95.1  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  40 
 
 		 505 aa  95.1  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 		 427 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.94 
 
 		 585 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  30.48 
 
 		 471 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 193 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  29.9 
 
 		 734 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  45.1 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  45.1 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  45.1 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  45.1 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  45.1 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.8 
 
 		 506 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 361 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.28 
 
 		 320 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  45.1 
 
 		 310 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  45.1 
 
 		 310 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 464 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.69 
 
 		 407 aa  90.5  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 286 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 230 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 316 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  28.72 
 
 		 263 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 623 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 463 aa  89  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.4 
 
 		 321 aa  88.2  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.02 
 
 		 240 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  49.43 
 
 		 223 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 1026 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.1 
 
 		 229 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 311 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  45.1 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.9 
 
 		 707 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  41.75 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>