116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4204 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4204  outer membrane protein  100 
 
 		 198 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.255099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  30.72 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  31.14 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  28.43 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  28.43 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  33.11 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  39.29 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  27.78 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  28.71 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  28.22 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  28.24 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.65 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  31.71 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  34.86 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  27.27 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.3 
 
 		 333 aa  62  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 362 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.39 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  30.06 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  31.5 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  31.5 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  27.69 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  28.76 
 
 		 484 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  30.89 
 
 		 478 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.19 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  29.34 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  32.2 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.66 
 
 		 345 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30.91 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 445 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.91 
 
 		 344 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  31.09 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  28.38 
 
 		 420 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.7 
 
 		 417 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.09 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30 
 
 		 344 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30 
 
 		 344 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  32.76 
 
 		 456 aa  51.2  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30 
 
 		 344 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30 
 
 		 344 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.61 
 
 		 427 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.09 
 
 		 345 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  33.8 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.17 
 
 		 350 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.17 
 
 		 350 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  29.52 
 
 		 337 aa  48.9  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  27.83 
 
 		 337 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  28.66 
 
 		 449 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  27.46 
 
 		 348 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  24.32 
 
 		 266 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  28.81 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  25 
 
 		 366 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 369 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  26.87 
 
 		 429 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  27.13 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.97 
 
 		 368 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  26.36 
 
 		 352 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  25.21 
 
 		 401 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25.6 
 
 		 404 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  24.12 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5131  OmpA/MotB domain protein  25.81 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  25 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  27.14 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  26.85 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 331 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  25.69 
 
 		 369 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  25.69 
 
 		 369 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.93 
 
 		 377 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.93 
 
 		 372 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  29.25 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>