More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2459 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  52.67 
 
 		 254 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  61.54 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  34.31 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  30.93 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  32.64 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  28.37 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  35.85 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.61 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  28.83 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  28.16 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.54 
 
 		 509 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 376 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.01 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  36.45 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.07 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 319 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  37.01 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.45 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 729 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  38 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.89 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.89 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.31 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 485 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.87 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 485 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.03 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  36.3 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 427 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 485 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.58 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.64 
 
 		 344 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.31 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35 
 
 		 447 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.03 
 
 		 345 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 637 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  35.51 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.55 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.55 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.89 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  36.22 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.98 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 485 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 537 aa  65.1  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 		 459 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.92 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>