More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0909 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  81.5 
 
 		 222 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  58.41 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  61.5 
 
 		 213 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  56.67 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  55.12 
 
 		 192 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  55.41 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  45.33 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  51.18 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  48.96 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  48.84 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  53.49 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  47.53 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  52.34 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  37.76 
 
 		 727 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.62 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.68 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  36.55 
 
 		 651 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  40.32 
 
 		 617 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.68 
 
 		 351 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.62 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.74 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.74 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.79 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 703 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 306 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  34.97 
 
 		 697 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.33 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  35.07 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 673 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 663 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.42 
 
 		 481 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.45 
 
 		 701 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 701 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.22 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.96 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 723 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 730 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.96 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  36.79 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  35.56 
 
 		 880 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 666 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  36.79 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.97 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.53 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 		 718 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.08 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.31 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  38.18 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.23 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.17 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.77 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.83 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 		 742 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 739 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 481 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.08 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  39.33 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  37.25 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  30.5 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.15 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>