More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1336 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  82.38 
 
 		 227 aa  331  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  65.16 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  63.94 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  60.49 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  59 
 
 		 192 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  48.02 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  46.63 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  48.19 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  48.6 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  47.34 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  42.79 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  48.73 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  29.15 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 197 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 269 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.97 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  40.87 
 
 		 727 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.38 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.38 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 617 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.52 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.12 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.66 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.66 
 
 		 351 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.89 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  36.43 
 
 		 651 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.72 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 697 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.19 
 
 		 420 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  33.33 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 720 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.39 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.37 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.29 
 
 		 701 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 701 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  36.62 
 
 		 673 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 703 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.39 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  47.31 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  40.18 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  35.78 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 485 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.01 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  42.68 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 717 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  47.14 
 
 		 880 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 730 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 485 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 742 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 742 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  44.09 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 485 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 		 739 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.05 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.17 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 443 aa  62  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 375 aa  61.6  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.13 
 
 		 375 aa  61.6  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.26 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.27 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  52.46 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.46 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  30.85 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>