More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2207 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  61.58 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  62.38 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  59.41 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  61.58 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  47.34 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  48.45 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  45.96 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  45.02 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  55.4 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  50 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  48.02 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  43.78 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 282 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 269 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  30.45 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.33 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.26 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 703 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.33 
 
 		 327 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.41 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.41 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.41 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.41 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.48 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.56 
 
 		 350 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 701 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.56 
 
 		 350 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 701 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 		 333 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 739 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  30 
 
 		 727 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 711 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.63 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 720 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 742 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  32.58 
 
 		 617 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.78 
 
 		 429 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.62 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 663 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.75 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 742 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 1619 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.65 
 
 		 466 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.21 
 
 		 447 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.27 
 
 		 261 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  29.61 
 
 		 651 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  30.26 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.3 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.04 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  30.92 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  37.74 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.24 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  31.13 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  31.82 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  33.96 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  34.51 
 
 		 880 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.5 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.69 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.24 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>