More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3028 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  57.5 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  55.98 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  45.75 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  50.54 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  46.11 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  50.68 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  45.11 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  48.12 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  47.53 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  44.6 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  46.55 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  32.29 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.03 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 711 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 		 701 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.66 
 
 		 701 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.38 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.81 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.89 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.95 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  43.69 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  27.86 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.04 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.04 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  34.11 
 
 		 617 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.04 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 		 730 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.04 
 
 		 344 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 703 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.04 
 
 		 345 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.89 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.72 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 485 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.72 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.17 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  30.3 
 
 		 651 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.61 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 481 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  32.56 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.21 
 
 		 466 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.29 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 468 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.62 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 742 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 466 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 485 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  38.6 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39.05 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 720 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.62 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  35.94 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.25 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.25 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  34.64 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>