More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0555 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  66.34 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  66.04 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  65.05 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  63.78 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  49.04 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  43.19 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  48.15 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  48.08 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  46.7 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  51.76 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  45.32 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 		 192 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 282 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 178 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  30.96 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  32.51 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  37.12 
 
 		 617 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  34.85 
 
 		 727 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  34.68 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.4 
 
 		 344 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 703 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  35.61 
 
 		 651 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.63 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.63 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.51 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.91 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.64 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.64 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.33 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.64 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 663 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.71 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  35.61 
 
 		 697 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.03 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.4 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 720 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  37.61 
 
 		 880 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.58 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  35.71 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  37.17 
 
 		 673 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.82 
 
 		 466 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 739 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 1619 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.82 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.84 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  33.59 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  33.81 
 
 		 730 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 701 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 723 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.79 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.67 
 
 		 701 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.89 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.61 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.1 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 718 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 717 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 345 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 432 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 434 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 666 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.45 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>