More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0870 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  100 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  43.24 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  39.42 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 433 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  37.84 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  33.73 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 454 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.15 
 
 		 466 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.64 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.21 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 322 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.24 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.03 
 
 		 457 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 485 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 374 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  32.74 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 742 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  35.54 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  30.61 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  37.25 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.43 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  31.61 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  29.76 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.27 
 
 		 669 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  37.04 
 
 		 880 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.51 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 671 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 412 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 742 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 337 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 711 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 739 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.94 
 
 		 478 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 314 aa  62  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 631 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.35 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.85 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  36.27 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.52 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  32.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  42.65 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  24.72 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.78 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  26.18 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 623 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  32.35 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 617 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>