More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1334 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  81.36 
 
 		 178 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  38.64 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  32.09 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  32.5 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  39.5 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.81 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  37.31 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  37.91 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  35.88 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.1 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  33.5 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 658 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  38.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  38.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 679 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  38.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  39.18 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  44.12 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  43.14 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.11 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 240 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.73 
 
 		 320 aa  72  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.27 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  42.31 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.27 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 361 aa  71.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  39.08 
 
 		 351 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 294 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.66 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  37.11 
 
 		 358 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.6 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 613 aa  70.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  36.89 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.62 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  38.6 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  36.18 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  42.16 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 485 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.16 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  42.16 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  40.21 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  39.08 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 485 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0927  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  37.93 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0930  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.05 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 459 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>