More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0729 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 282 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  68.7 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  42.99 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  46.55 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  45.79 
 
 		 208 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 217 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 216 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  40.19 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  31.28 
 
 		 216 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  36.18 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.38 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.79 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.25 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.14 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  44.25 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  30.22 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.65 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.74 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  32.54 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.78 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.59 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  32.08 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 730 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.78 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  27.8 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.44 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.91 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  32.41 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.91 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.91 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  32.03 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.04 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.04 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.04 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.04 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.3 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  37.74 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.02 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  28.19 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  32.58 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  34.4 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  41.86 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.91 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  35.34 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  33.03 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.04 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  37.1 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.97 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  37.82 
 
 		 1619 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 485 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.04 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 		 640 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>