More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2141 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 520 aa  1051    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  50.95 
 
 		 523 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  53.99 
 
 		 524 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  45.54 
 
 		 1984 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  45.63 
 
 		 2000 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.96 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.1 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.86 
 
 		 669 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.74 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.62 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.19 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.62 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.62 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  27.1 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 167 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  52.86 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  52.86 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 264 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.54 
 
 		 228 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 241 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.69 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 264 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 263 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  38.71 
 
 		 241 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 210 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  44 
 
 		 214 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 169 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  44 
 
 		 186 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.42 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.38 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.45 
 
 		 420 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.88 
 
 		 218 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 212 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  38.79 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 376 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  41 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  36.36 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.81 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  30.82 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  33.06 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.84 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.5 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.54 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.24 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.33 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  37.86 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>