123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0330 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 730 aa  1363    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.15 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  55.63 
 
 		 701 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  39.57 
 
 		 742 aa  187  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  39.31 
 
 		 663 aa  184  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  36.45 
 
 		 880 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  38.16 
 
 		 742 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  39.78 
 
 		 720 aa  177  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 703 aa  174  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 651 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 697 aa  167  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  56.52 
 
 		 673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  40.73 
 
 		 718 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 723 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 717 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 666 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  41.61 
 
 		 727 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  42.29 
 
 		 624 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  40.67 
 
 		 348 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 306 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  35.97 
 
 		 213 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 213 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  32.37 
 
 		 216 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 227 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  37.41 
 
 		 550 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 269 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 217 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  37.07 
 
 		 203 aa  63.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 282 aa  62  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.04 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.5 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.74 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  32.89 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.76 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  34.78 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  37.61 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 1619 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  30.39 
 
 		 207 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  37.04 
 
 		 331 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 286 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 578 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 569 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 578 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 443 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.9 
 
 		 352 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  36.29 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.04 
 
 		 229 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  36.97 
 
 		 558 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  30.09 
 
 		 377 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  36.29 
 
 		 558 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 		 486 aa  55.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 454 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.18 
 
 		 337 aa  55.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 220 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  39.74 
 
 		 578 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 576 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  35.48 
 
 		 542 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  36.47 
 
 		 264 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 429 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.79 
 
 		 434 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 401 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  37.07 
 
 		 648 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.04 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 		 432 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.78 
 
 		 447 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  36.28 
 
 		 315 aa  52.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 359 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.6 
 
 		 213 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 213 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 		 304 aa  51.2  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 		 216 aa  50.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 380 aa  50.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  35.04 
 
 		 240 aa  50.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  31.48 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 261 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 310 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 		 335 aa  50.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 398 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  30.82 
 
 		 230 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 178 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 229 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  39.29 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>