62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0695 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 624 aa  1147    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  72.78 
 
 		 666 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 717 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  46.42 
 
 		 718 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  69.81 
 
 		 723 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  61.39 
 
 		 348 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  57.56 
 
 		 673 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  58.02 
 
 		 697 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  59.73 
 
 		 651 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  58.56 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  60 
 
 		 727 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  49.75 
 
 		 663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  59.17 
 
 		 306 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  48.03 
 
 		 742 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  44.84 
 
 		 742 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  44.68 
 
 		 739 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  41.33 
 
 		 880 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  45.86 
 
 		 720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  46.01 
 
 		 703 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  39.93 
 
 		 711 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.3 
 
 		 701 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.95 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.2 
 
 		 2449 aa  85.5  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  29.25 
 
 		 3409 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  29 
 
 		 3521 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.77 
 
 		 2914 aa  77.4  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.75 
 
 		 3472 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  29.75 
 
 		 3471 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.71 
 
 		 2179 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.53 
 
 		 1888 aa  64.7  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 		 227 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 208 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.82 
 
 		 314 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.66 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 216 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.8 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  36.96 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.58 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  35.2 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.02 
 
 		 466 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 270 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.54 
 
 		 229 aa  55.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  33.05 
 
 		 212 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 269 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  47.22 
 
 		 1619 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  32.43 
 
 		 261 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  43.48 
 
 		 187 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  32.43 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  31.06 
 
 		 218 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  35.66 
 
 		 1745 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  37.17 
 
 		 1049 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>