More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3121 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  74.48 
 
 		 210 aa  275  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  63.69 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  61.83 
 
 		 222 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  59.38 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  55.5 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  45.88 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  45.86 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  43.98 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  42.35 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  46.89 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  48.84 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  47.66 
 
 		 217 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.67 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  36.59 
 
 		 703 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.53 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.53 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.96 
 
 		 351 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 375 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.89 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.89 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  33.53 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.53 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.53 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.3 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.53 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  37.96 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.61 
 
 		 345 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 359 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 617 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  46.09 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  28.96 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  51.85 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 742 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.53 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 701 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.07 
 
 		 701 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  30.23 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.44 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 742 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 663 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  44.58 
 
 		 739 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.12 
 
 		 447 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 263 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.29 
 
 		 365 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.61 
 
 		 466 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  36.44 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  29.32 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 697 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 362 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  36.44 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 443 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  37.27 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 723 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.64 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  43.28 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  33.96 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.42 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  43.84 
 
 		 624 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 730 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  46.38 
 
 		 880 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  43.66 
 
 		 572 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  34.45 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 717 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  32.05 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  44.74 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  45.57 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.83 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>