More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4062 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  32.29 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  40.16 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  34.97 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.59 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  28.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  31.31 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.59 
 
 		 510 aa  68.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  33.59 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 498 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.23 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  35.25 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  34.38 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  37.12 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.34 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.53 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  35.82 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.05 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 525 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.93 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 487 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 652 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 316 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  35.61 
 
 		 652 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 314 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 463 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.05 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.13 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  39.62 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.93 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  28.86 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  33.59 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 543 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  36.36 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  36.36 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.95 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  36.36 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  36.36 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  36.36 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.25 
 
 		 542 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  36.36 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.07 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.38 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.51 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  34.4 
 
 		 613 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  41.28 
 
 		 1793 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  36.36 
 
 		 310 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 311 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  32.12 
 
 		 367 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  36.36 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  35.07 
 
 		 485 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>