More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0835 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  76.06 
 
 		 213 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  65.46 
 
 		 222 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  60.68 
 
 		 210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  60.7 
 
 		 227 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  59.38 
 
 		 192 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  50.54 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  50 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  47.54 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  46.03 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  44.2 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  43.72 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  43.68 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  32.99 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  38.57 
 
 		 617 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  40.19 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 720 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  40.54 
 
 		 727 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 742 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  25.41 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 651 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 673 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 703 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 269 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.34 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  40 
 
 		 663 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 697 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 742 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  37.04 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.79 
 
 		 351 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 375 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.79 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  32.99 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.39 
 
 		 701 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 701 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.07 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  34.71 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 723 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 666 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 739 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.65 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.91 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.07 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.07 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.45 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.71 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.71 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 717 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 296 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 624 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 368 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  30.57 
 
 		 479 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.48 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.17 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.19 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  40.78 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  32.52 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.02 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.91 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  34.59 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.53 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  32.59 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.51 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.53 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.04 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 468 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>