276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4749 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 717 aa  1355    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  81.25 
 
 		 718 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  96.13 
 
 		 723 aa  1107    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  74.44 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  54.69 
 
 		 666 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  69.81 
 
 		 624 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  56.35 
 
 		 673 aa  333  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  57.82 
 
 		 697 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  59.18 
 
 		 651 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  53.05 
 
 		 663 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  58.39 
 
 		 306 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  57 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  55.77 
 
 		 727 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 742 aa  226  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  43.77 
 
 		 742 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 720 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  42.66 
 
 		 739 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  37.26 
 
 		 880 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  45.2 
 
 		 703 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 		 711 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 701 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.43 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  39.93 
 
 		 730 aa  177  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.38 
 
 		 2449 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.17 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  34.78 
 
 		 213 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 270 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 217 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.61 
 
 		 3409 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.46 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 314 aa  60.1  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  34.23 
 
 		 185 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  40.37 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  50 
 
 		 1619 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.04 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.67 
 
 		 2179 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.29 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.82 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  37.5 
 
 		 271 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 270 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.61 
 
 		 224 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.25 
 
 		 233 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 359 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 428 aa  57  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 440 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 356 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 229 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 374 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.07 
 
 		 316 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 192 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 638 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 631 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 203 aa  55.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  49.09 
 
 		 213 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 270 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 575 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.11 
 
 		 422 aa  55.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.62 
 
 		 2272 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 241 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  36.7 
 
 		 241 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.61 
 
 		 241 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 201 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.93 
 
 		 261 aa  54.7  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  32.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 204 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 		 160 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  47.46 
 
 		 296 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 160 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.34 
 
 		 364 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  32.17 
 
 		 212 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  34.71 
 
 		 321 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 209 aa  54.3  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 417 aa  54.3  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  34.82 
 
 		 290 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 333 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  31.09 
 
 		 216 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.88 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.88 
 
 		 261 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 		 285 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 377 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.07 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.07 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>