More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0585 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  99.14 
 
 		 701 aa  1342    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 701 aa  1353    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  66.6 
 
 		 730 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 		 711 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  39.93 
 
 		 673 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 663 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  39.44 
 
 		 703 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  45.11 
 
 		 718 aa  177  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  38.26 
 
 		 880 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  44.68 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 742 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 651 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  37.28 
 
 		 742 aa  173  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  40.22 
 
 		 697 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  39.72 
 
 		 617 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 		 348 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  37.45 
 
 		 720 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  42.91 
 
 		 727 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  39.3 
 
 		 624 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  37.99 
 
 		 306 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  34.66 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.94 
 
 		 208 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 222 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  38.46 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  37.07 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 263 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 264 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 223 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  37.61 
 
 		 240 aa  60.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  34.88 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.9 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  33.82 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.84 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.75 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.24 
 
 		 429 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.19 
 
 		 466 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  36.69 
 
 		 550 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 260 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.77 
 
 		 233 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 434 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 212 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.94 
 
 		 261 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  31.21 
 
 		 212 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  37.17 
 
 		 315 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.94 
 
 		 261 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  30.43 
 
 		 286 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 398 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.03 
 
 		 447 aa  55.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 359 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 510 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 217 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 468 aa  55.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 216 aa  55.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 377 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.72 
 
 		 241 aa  54.7  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.13 
 
 		 224 aa  54.3  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 304 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 443 aa  54.3  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 326 aa  54.3  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.43 
 
 		 209 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.26 
 
 		 260 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  38.04 
 
 		 195 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 569 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>