121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2068 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  100 
 
 		 880 aa  1707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  60.61 
 
 		 742 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  56.11 
 
 		 739 aa  466  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 742 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  47.25 
 
 		 703 aa  310  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  43 
 
 		 673 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  43.01 
 
 		 663 aa  218  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  46.1 
 
 		 617 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  44 
 
 		 697 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  46.84 
 
 		 651 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  41.72 
 
 		 723 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  43.73 
 
 		 718 aa  195  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  44.36 
 
 		 727 aa  195  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 717 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 666 aa  194  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 		 624 aa  190  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 306 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 701 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  49.43 
 
 		 348 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.26 
 
 		 701 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  36.12 
 
 		 730 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  35.17 
 
 		 711 aa  162  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  45.08 
 
 		 1619 aa  73.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 216 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.82 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.78 
 
 		 233 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  34.19 
 
 		 212 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 213 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 227 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  47.14 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  33.76 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.84 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 229 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 270 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 270 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  44.05 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 454 aa  62  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.23 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.78 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  38.3 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 208 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  34.51 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.38 
 
 		 188 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  37.36 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.94 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40.23 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.42 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.23 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.66 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.66 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.66 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.96 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 457 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 263 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 310 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.66 
 
 		 345 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 367 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.36 
 
 		 210 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  36.79 
 
 		 222 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 263 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 468 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  40.28 
 
 		 217 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 640 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 218 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 		 205 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 		 367 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.56 
 
 		 344 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  33.63 
 
 		 464 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.77 
 
 		 447 aa  55.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  36.76 
 
 		 1984 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  49.12 
 
 		 466 aa  54.7  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.48 
 
 		 429 aa  54.7  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 366 aa  54.3  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 		 363 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 316 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 		 369 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>