36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0065 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  100 
 
 		 617 aa  1143    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  80.73 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  60.26 
 
 		 673 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  84.59 
 
 		 306 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  65.65 
 
 		 663 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  58.22 
 
 		 666 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  57.99 
 
 		 723 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  56.33 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  58.56 
 
 		 624 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  56.33 
 
 		 718 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  56.51 
 
 		 348 aa  293  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  45.91 
 
 		 742 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  44.48 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  46.1 
 
 		 880 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  44.73 
 
 		 742 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 720 aa  230  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  38.73 
 
 		 703 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 711 aa  187  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 		 701 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 701 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 730 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  40.97 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.87 
 
 		 2449 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 222 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 216 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  38.14 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  33.79 
 
 		 217 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  36.13 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  36.94 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.12 
 
 		 239 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  32.45 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  49.25 
 
 		 192 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  32.45 
 
 		 216 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>