115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4324 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 711 aa  1354    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  53.89 
 
 		 701 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  53.59 
 
 		 701 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  52.71 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  43.07 
 
 		 697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  42.81 
 
 		 651 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  43.07 
 
 		 718 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  42.7 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 		 717 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  44.15 
 
 		 348 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  40.83 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 666 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  42.7 
 
 		 727 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 742 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  41.73 
 
 		 617 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  35.17 
 
 		 880 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  39.93 
 
 		 624 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  36.62 
 
 		 663 aa  163  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  41.26 
 
 		 306 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  33.22 
 
 		 739 aa  154  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  34.18 
 
 		 703 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  34.09 
 
 		 216 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 203 aa  63.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 288 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.18 
 
 		 320 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  33.9 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  35.9 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.79 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  31.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  31.53 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.65 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  37.14 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  32.43 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  32.43 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.83 
 
 		 271 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.68 
 
 		 229 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.63 
 
 		 457 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.88 
 
 		 2449 aa  57  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 263 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 223 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 263 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  30.63 
 
 		 260 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.48 
 
 		 364 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  33.63 
 
 		 212 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 227 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 192 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 296 aa  55.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 262 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 229 aa  55.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  36.44 
 
 		 269 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 213 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 212 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 1619 aa  54.7  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.44 
 
 		 269 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  44.78 
 
 		 213 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  33.9 
 
 		 271 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 236 aa  53.9  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.08 
 
 		 427 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 215 aa  53.9  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.47 
 
 		 466 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.25 
 
 		 640 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 220 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 222 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  35 
 
 		 3242 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 		 314 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  31.21 
 
 		 459 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.29 
 
 		 429 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.63 
 
 		 432 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 273 aa  52  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  32.54 
 
 		 339 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.63 
 
 		 434 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 		 648 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.88 
 
 		 344 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.64 
 
 		 213 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.88 
 
 		 344 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.88 
 
 		 344 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 213 aa  50.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.53 
 
 		 217 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>