28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0237 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  100 
 
 		 727 aa  1291    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  69.76 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  63.44 
 
 		 673 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  72.52 
 
 		 651 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  74.74 
 
 		 306 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  65.12 
 
 		 663 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  60.62 
 
 		 666 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  59.79 
 
 		 624 aa  316  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  56.48 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  56.48 
 
 		 718 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  59.25 
 
 		 348 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  44.84 
 
 		 880 aa  240  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  43.94 
 
 		 742 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  46.39 
 
 		 720 aa  230  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  41.87 
 
 		 739 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  43.73 
 
 		 742 aa  227  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  43.49 
 
 		 711 aa  190  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  47.28 
 
 		 701 aa  184  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.28 
 
 		 701 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  41.91 
 
 		 730 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  36.64 
 
 		 703 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.94 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 208 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  28.38 
 
 		 553 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>