More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1379 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
553 aa  1125    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  75.89 
 
 
291 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  75.44 
 
 
292 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  74.02 
 
 
292 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  55 
 
 
327 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  40.43 
 
 
291 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40.36 
 
 
289 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  39.78 
 
 
291 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  42.03 
 
 
290 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  41.67 
 
 
290 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  42.5 
 
 
288 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  42.14 
 
 
288 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  42.5 
 
 
283 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  41.88 
 
 
277 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  40.86 
 
 
280 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.35 
 
 
277 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  40.79 
 
 
275 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  40.07 
 
 
277 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  40.94 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
275 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  36.23 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 
275 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.28 
 
 
281 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  40.74 
 
 
270 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 
277 aa  189  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  37.96 
 
 
287 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  38.55 
 
 
287 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.84 
 
 
309 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
276 aa  187  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  37.82 
 
 
287 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  38.71 
 
 
271 aa  186  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  41.42 
 
 
275 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  35.62 
 
 
299 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.28 
 
 
292 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
283 aa  182  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.91 
 
 
284 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0416  chemotaxis protein methyltransferase  37.68 
 
 
285 aa  178  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.783247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  39.41 
 
 
275 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.01 
 
 
290 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  35.47 
 
 
301 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 
292 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 
281 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  35.13 
 
 
283 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  35.09 
 
 
301 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 
290 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  38.58 
 
 
284 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.73 
 
 
463 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  40.24 
 
 
622 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.07 
 
 
274 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
281 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  34.04 
 
 
302 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  35.61 
 
 
283 aa  170  6e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  34.67 
 
 
271 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 
414 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  33.81 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 
288 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  36.74 
 
 
285 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
299 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  36.6 
 
 
289 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  34.19 
 
 
274 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 
280 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  36.36 
 
 
283 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 
285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  35.36 
 
 
285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  38.22 
 
 
272 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  32.37 
 
 
468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  36.92 
 
 
280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.3 
 
 
280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  32.96 
 
 
290 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
271 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  34.28 
 
 
303 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.86 
 
 
614 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
300 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  34.34 
 
 
303 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  35.84 
 
 
285 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  33.97 
 
 
289 aa  160  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  34.28 
 
 
303 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  34.23 
 
 
270 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  34.11 
 
 
271 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  33.81 
 
 
275 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  32.99 
 
 
291 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  36.94 
 
 
269 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  35 
 
 
283 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 
289 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  34.18 
 
 
274 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.82 
 
 
274 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  35.36 
 
 
273 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  32.36 
 
 
291 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
287 aa  157  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  33.33 
 
 
305 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
290 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  34.77 
 
 
295 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  34.72 
 
 
285 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  32.97 
 
 
305 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.66 
 
 
611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 
275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.19 
 
 
269 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 
273 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  31.68 
 
 
292 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 
300 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>