More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0900 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  78.85 
 
 		 217 aa  334  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  57.5 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  49.49 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  47.55 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  46.86 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  57.97 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  48.77 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  49.72 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  46.52 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  53.49 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.41 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  48.28 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  35.46 
 
 		 617 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 673 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  37.07 
 
 		 663 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.94 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 697 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 703 aa  75.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  27.89 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.46 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 718 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 723 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.51 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.51 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 717 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.51 
 
 		 345 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.51 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.51 
 
 		 344 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.94 
 
 		 701 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 701 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.51 
 
 		 344 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.05 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  34.58 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  34.19 
 
 		 651 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.38 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.65 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.68 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.74 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  32.38 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  36.04 
 
 		 727 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.81 
 
 		 640 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 		 401 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.45 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.92 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  40.86 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 666 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.43 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.43 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.64 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.79 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  40.43 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 730 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.38 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.53 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.43 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.43 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.43 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.43 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.43 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.05 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>