More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2862 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  35.18 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  42.24 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  33.49 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  34.07 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  33.69 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  38.74 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  30.73 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  41.96 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  41.96 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  41.96 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  41.96 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  41.96 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  41.96 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 		 320 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  42.62 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  41.96 
 
 		 310 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  41.96 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.07 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  43.36 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  31.28 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  34.1 
 
 		 331 aa  71.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  31.96 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  35.19 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 658 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  28.87 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.28 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  41.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 651 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 525 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  35.24 
 
 		 712 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  40.17 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  42.73 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  38.68 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  41.82 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 711 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 701 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  40.54 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 		 481 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 701 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.67 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  33.79 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.51 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  33.06 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  35.24 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  40 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.24 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.59 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  45.59 
 
 		 572 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 485 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 479 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.16 
 
 		 542 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.8 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  30.5 
 
 		 498 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.14 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>