More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0915 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  416  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  74.48 
 
 		 192 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  63.78 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  60.68 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  60.62 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  57.07 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  49 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  47.03 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  46.03 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  43.65 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  39.41 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  44.6 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  41.84 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  26.7 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.04 
 
 		 350 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.04 
 
 		 350 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  37.61 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.19 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  36.36 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  33.09 
 
 		 617 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  48.05 
 
 		 429 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  35.8 
 
 		 331 aa  62  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 362 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  36.84 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.78 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  26.46 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 739 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.94 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 703 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.14 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  34.04 
 
 		 880 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.15 
 
 		 447 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.22 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  32.64 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.33 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  33.94 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.04 
 
 		 359 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 651 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  39.08 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.11 
 
 		 337 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 673 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  38.89 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.92 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  33.09 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  44.21 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.64 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  44.21 
 
 		 558 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 697 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.58 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 663 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 742 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.07 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 742 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.56 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  43.16 
 
 		 558 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  43.16 
 
 		 558 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.11 
 
 		 375 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.08 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  49.02 
 
 		 420 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 375 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.08 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.35 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  33 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  49.21 
 
 		 439 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>