More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1992 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  57.02 
 
 		 189 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  41.05 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  53.72 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.92 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  36.36 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  42.31 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.25 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.93 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 433 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.33 
 
 		 351 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.14 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.25 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40.43 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.25 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  37.5 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.43 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.51 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.28 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.29 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  35 
 
 		 703 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.25 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  34.29 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  37.23 
 
 		 333 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.04 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  32.17 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  26.38 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.63 
 
 		 350 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.63 
 
 		 350 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.82 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  30.33 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.32 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  32.71 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  33.01 
 
 		 712 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 485 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  31.48 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 666 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.13 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  34.48 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.52 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>