More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0896 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  84.91 
 
 		 212 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  69.12 
 
 		 216 aa  280  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  67.89 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  62.09 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  49.46 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  46.86 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  49 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  51.48 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  48.73 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  46.11 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  50 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  51.18 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  45.88 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 269 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 189 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  36.87 
 
 		 178 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.74 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.67 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  28.37 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  41.28 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  36.73 
 
 		 703 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.81 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.81 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.81 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.96 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.89 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 487 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.51 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.11 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.44 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.48 
 
 		 429 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.25 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.07 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  55.07 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 637 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  34.42 
 
 		 880 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  34.53 
 
 		 617 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  35 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.57 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.62 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.51 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  35.79 
 
 		 439 aa  69.3  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.21 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.1 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 739 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  31.31 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  35.65 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  31.54 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 485 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.14 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.45 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 376 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.5 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 651 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.11 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>