More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3033 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  67.67 
 
 		 282 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  46.23 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  45.79 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  44.34 
 
 		 208 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  43.4 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  44.34 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  40.57 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  38.56 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.71 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.62 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.56 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.81 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.56 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.65 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.46 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.23 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  33.79 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.57 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 432 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.94 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.34 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.23 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 1619 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.38 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  34.26 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  33.07 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.59 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.09 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  37.04 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  38.68 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.7 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.33 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.45 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.98 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  42.31 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.63 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.16 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  34.78 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  42.31 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>