More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0911 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  81.36 
 
 		 178 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  43.18 
 
 		 216 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  36.87 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  32.58 
 
 		 212 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  35.47 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  39.26 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  39.85 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  40 
 
 		 658 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  37.32 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  38.56 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.35 
 
 		 266 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.82 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  36.67 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  34.71 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  34.71 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  38.81 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  38.14 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.48 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  43.27 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.02 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.2 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  44.12 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.7 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 481 aa  67.8  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.48 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  37.11 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  43.14 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  36.08 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.08 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  36.08 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  36.08 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  42.16 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  36.08 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.6 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  30.72 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  36.08 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.16 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  35.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  36.08 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  39.6 
 
 		 617 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.06 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  36.08 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  42.16 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.9 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2372  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0195446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 485 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 487 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  35.05 
 
 		 358 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.68 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  34.68 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  35.05 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  35.05 
 
 		 369 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.53 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.53 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  35.05 
 
 		 371 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 485 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>