More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1403 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 213 aa  420  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  76.06 
 
 		 213 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  65.16 
 
 		 222 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  62.76 
 
 		 210 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  61.5 
 
 		 227 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3121  OmpA/MotB domain protein  61.26 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  46.89 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  46.88 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  46.45 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  47.62 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  47.87 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  46.88 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  31.96 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.74 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.87 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.87 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 617 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.98 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4062  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.13 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.26 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.26 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6143  hypothetical protein  25.51 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0659016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 742 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.45 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 651 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  40 
 
 		 703 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  37.61 
 
 		 727 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 720 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 742 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  43.69 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.33 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  47.62 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  35.71 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  41.49 
 
 		 880 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  51.72 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5114  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 701 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 701 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.15 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.83 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  37.7 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  35 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.3 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 697 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  48.53 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.81 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  52.38 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.22 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 637 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  37.37 
 
 		 1619 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.04 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.42 
 
 		 447 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  38.1 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  46.03 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  34.91 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  40.22 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.12 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.02 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  29.19 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>